Президент України Віктор Ющенко звільнив міністра оборони Анатолія Гриценка з посади, не тільки не пояснивши причини, а навіть не поговоривши з ним. Про це екс-міністр оборони, нардеп від НУ-НС Анатолій Гриценко заявив в ефірі "Свободи слова" на ІСTV. "З Президентом не було розмови ні живої, ні телефонної, ні за тиждень, ні за день, ні в день, ні після того", - сказав А.Гриценко, додавши, що звільнення стало несподіванкою як для нього, так і для всієї фракції НУ-НС.
При цьому А.Гриценко відзначив, що "спокійний за армію" після своєї відставки. "За ці два роки і десять місяців роботи в трьох урядах в складних умовах ми почали і здійснили на багатьох напрямах глибокі і системні зміни з підвищення боєздатності наших Озброєних сил, тому я упевнений, що і далі армія розвиватиметься поступово", — підкреслив він.
Екс-міністр переконаний, що його наступникові Юрію Єханурову важко буде працювати міністром оборони, але зі свого боку обіцяє сприяти розвитку армії законодавчою роботою.
Відповідаючи на питання, чи не сприяла його відставці принципова незгода безкоштовно передавати землі Міноборони бізнесменам, наближеним до владних кругів, А.Гриценко зауважив, що такі спроби були і в Києві, і в Одесі, і в Дніпропетровську.
Нагадаємо, 18 грудня А.Гриценко заявив РБК-Україна, що В. Ющенко не погоджував з ним кандидатуру Ю.Єханурова на посаду голови Міноборони і не пропонував йому очолити РНБО: "Я не отримував ніяких пропозицій. Я не хочу отримувати ніяких пропозицій від Президента Ющенка. Я не прийму жодної пропозиції по роботі у виконавчій владі", - підкреслив він.
11 грудня Президент України вніс кандидатуру Ю. Єханурова на посаду міністра оборони, мотивуючи тим, що це прискорить процес реформування армії.
В лютому 2005 року А.Гриценко був призначений Міністром оборони України в уряді Юлії Тимошенко. Потім керував оборонним відомством в Кабміні Ю.Єханурова.
4 серпня 2006 року призначений головою Міноборони в уряді Віктора Януковича Верховною Радою за квотою Президента В.Ющенка.
На позачергових парламентських виборах-2007 пройшов до ВР під №4 пропрезидентського блоку "Наша Україна – Народна самооборона".